因應新冠肺炎疫情疫情持續延燒，黃偉哲市長指示配合中央綠能政策，市府要求各區域營運商訪視屋主及進場施工期間，應做好防疫相關防護管理，訂定員工體溫∕健康監測原則，與設備消毒執行措施，並要求相關人員應佩戴口罩與識別證，使民眾安心參與綠能屋頂計畫。
黃偉哲市長說，因全球疫情造成太陽光電零組件進口短缺，影響在建案場完工時程，市府配合經濟部政策，將展延綠能屋頂計畫案場於108年10月至12月取得同意備案者之躉購費率適用期限2個月至本（109）年6月30日，減緩綠能屋頂營運商因短期缺料之完工併網適用費率壓力。另市府與各營運商簽有合作契約，對於已參加或有意願參加綠能屋頂的民眾及業者，都能提供適時保障，不致因疫情影響導致各方權益受損。
經發局長陳凱凌表示，綠能屋頂建置屬於自由競爭市場，民眾可自行選擇施作廠商，目前計畫推行或許受疫情有短暫影響，在做好相關防護措施前提下，市府仍會持續進行綠屋推廣，有意參與綠能屋頂建置之民眾及企業屋主，可逕洽所屬行政區之營運商，由營運商評估後，協助提供一條龍的服務，從申辦文件需求、屋頂違章諮詢、申辦程序、現場勘驗設計施工等，簡化民眾申請手續。
經發局進一步表示，基於推廣綠能屋頂計畫，遂辦理遴選區域營運商供市民選擇，本市各行政區域綠能屋頂營運商聯絡方式如下表，有意願參加綠能屋頂計畫之民眾，可逕洽所屬區域營運商聯繫。民眾如對於太陽能屋頂系統建置有相關問題，可洽市府免費諮詢專線0800-333-889，或上臺南市綠能屋頂專屬入口網站（http://solarcity.tainan.gov.tw/greenhouse/）查詢相關訊息。