沙崙綠能科學城是結合研發、試產與量產的整體開發計畫，目的是帶動台灣下一世代的產業發展，未來的台南，期許會有更多的年輕子弟回來這塊土地。台糖港墘農場規劃為綠能園區目標在形塑綠能上中下游產業鏈，未來園區規劃引進低污染、無煙囪之智慧綠能產業，故不會有空污沈降問題、況且污水專管放流及園區四周設置綠地及滯洪池緩衝隔離，不致對鄰區造成影響。
對於現有的人造林，市府除了做現地保留，也會配合當地公園綠地的規劃，移植到更好的生長環境。並非如影片所言要砍除樹木，而是將現有樹種移植於園區公園綠地及廠商退縮地移植復育、妥善養護、疏枝，讓樹木有更好的生長環境，這樣樹木是對生態最友善及既有環境最好的方法，延續造林樹種生命與生態豐富度，無損農場原有淨化空氣之能力。
園區規劃資訊公開透明，現階段先就基地內樹種及生長狀況進行調查，完成後將研訂移植計畫，據以審慎的遷移、保存樹木，以利後續執行實質開發工作。有關網路上散播市府會砍掉59公頃樹木一事並非事實，請市民朋友毋須恐慌，如有疑問可逕自洽詢經發局，切勿輕信或轉載不實消息。