食品安全為國人所高度關注之焦點，為落實食安五環改革政策，南市府每季召集食安會議，持續為食安把關並強化食品安全管理，南市府經發局亦積極配合加強稽查並落實輔導未登記食品工廠合法化。依工廠管理輔導法修法規定自109年3月20日受理未登記食品工廠申請納管，截至目前經發局已輔導未登記食品業者計125家申請納管，其中4家取得特定工廠登記，另有80家臨時登記工廠取得特定工廠登記，並輔導137家食品業者取得一般工廠登記。
市長黃偉哲表示，為有效管理及輔導未登記食品工廠，針對新增未登記工廠本府皆依經濟部「未登記工廠停止供電供水作業程序」，自109年3月20日後針對未登記工廠查處應依工廠管理輔導法第30條規定立即停工，經複查未停工者即處以停止供水、供電並處2至6萬元罰鍰。
經發局局長林榮川說，為避免工業化學物質被不肖業者使用於食品製造或加工，依經濟部選定化學物質，南市目前列管12家，其每年1月份及7月份皆需向南市府申報流向資訊。另為防止工業用油脂不當流入食品造成重大食品安全事件，南市每月進口一般工業用油脂之工廠計42家，須向南市府申報一般工業用油脂儲存及流向資訊，經發局每年皆針對選定化學物質工廠及進口一般工業用油脂工廠，不定期查核。目前查核缺失，主要為進口時誤填該公司另一廠地址，皆請業者依規定辦理改善。
南市府呼籲相關食品業者應作好食品業者登錄，提供消費者更透明化的業者資訊。且依照法規提供完善之食品標示資訊，使消費者能依此選購符合需求之食品。並負起企業責任，勿生產、製造、販售不安全食品。從原料經加工製造至產品整個流程皆應做好食品安全自主管理，以保障消費端權益，維護市民健康。